La loi n°8-2019 du 9 avril 2019 portant création du FONEA et le décret n°2019-169 du 1er juillet 2019 fixant ses statuts, prévoient le mode de financement et les instances de gouvernance comme suit : 

1. SOURCES DE FINANCEMENT 

Le FONEA est abondé principalement par :

a) la taxe d’apprentissage soit une part de la Taxe Unique sur les Salaires (TUS) équivalente à 1% de la masse salariale des entreprises cotisantes à la CNSS

b) l a subvention de l’Etat

c) les prestations

d)  les appuis des partenaires au développement

2. GOUVERNANCE

Les organes de direction du FONEA sont :

2) La Direction Générale (DG) est  constituée de 6 directions centrales, d’une agence comptable et d’une délégation au contrôle budgétaire.  La Direction Générale du FONEA est dirigée par un Directeur Général nommé par décret présidentiel pris en  Conseil des Ministres . Les directeurs centraux sont nommés par décret du Premier Ministre.

3) La Commission d'Orientation pour l'Emploi (COPE) est constituée de 9 membres dont 6 du secteur privé. Elle est mise en place par le Président du CODIR pour favoriser le partenariat entre le FONEA et le secteur privé. La COPE est une instance consultative ayant pour mission d’assurer l’interface et le dialogue permanent entre le FONEA et les entreprises congolaises en vue de  :

•           Favoriser l’adéquation entre l’offre de formation et les besoins du marché du travail ;
• Développer l’employabilité des personnes à la recherche d’un emploi et les compétences des salariés.